Unterschied zwischen der gesamten Genomsequenzierung und der Sequenzierung der nächsten Generation

In den letzten Jahrzehnten hat unser Verständnis des menschlichen Genoms exponentiell zugenommen, zusammen mit dem schnellen Wachstum von Sequenzdatenbanken und Bioinformatik -Tools. Und der Druck, mehr, schnellere und billigere DNA -Sequenzen zu erzeugen, werden für die wissenschaftliche Forschung zentral. Im ersten Jahrzehnt des 21. Jahrhunderts ermöglichten Fortschritte bei Microarray-Techniken Wissenschaftlern und Forschern, das menschliche Genom mit zunehmender Auflösung zu analysieren. Die herkömmlichen Techniken haben ihre Grenzen, die die Entwicklung neuer experimenteller Methoden erfordern. Die Sanger -Sequenzierungsmethode, die weiterhin als Goldstandard für die Sequenzierung angesehen wird. Mit der Fähigkeit, mehr als eine Million DNA-Fragmente gleichzeitig zu sequenzieren, hat die Sequenzierung der nächsten Generation (NGS) die Fähigkeit revolutioniert, große Volumina von Sequenzdaten zu extrem niedrigen Kosten zu erzeugen.

Was ist die ganze Genomsequenzierung?

Die gesamte Genomsequenzierung (WGS) ist eine umfassende Methode zur Analyse der gesamten genomischen DNA -Sequenz einer Zelle zu einem einzigen Zeitpunkt. WGS ist eine Technologie, mit der Wissenschaftler die genaue Abfolge aller Buchstaben lesen können, aus denen Ihre vollständige DNA -Menge besteht. Das menschliche Genom ist immer noch schlecht verstanden und selbst der am besten untersuchte Teil des Genoms wird durch ungefähr 3% des Genoms, das Proteine ​​kodiert, dargestellt. Und die Funktionen der Proteine ​​im menschlichen Genom sind ebenfalls teilweise verstanden. Aus diesen Gründen zielt die Berechnungsanalyse von Genomsequenzdaten darauf ab, die medizinische Bedeutung aller funktionellen Elemente des Genoms einzusetzen und Genfunktionen und ihre Beteiligung an der Krankheit zu identifizieren. Es wird erwartet. WGS beinhaltet die Sequenzierung des gesamten Genoms, um Mutationen und Umlagerungen zu untersuchen.

Was ist Sequenzierung der nächsten Generation?

Es gibt keine genaue Definition der Sequenzierung der nächsten Generation (NGs). Die Sequenzierung der nächsten Generation, auch als massiv parallele Sequenzierung bekannt, ist eine relativ neue Technik, die die Sequenzierung eines DNA. NGS ist eine leistungsstarke Plattform, die das Gebiet der biologischen Wissenschaften revolutioniert hat, indem er die Fähigkeit zur DNA -Sequenzierung mit beispiellose Geschwindigkeit demonstriert und eine Option mit hohem Durchsatz anbietet, wodurch mehrere Personen gleichzeitig die Sequenzierung ermöglicht werden können. Dies wird erreicht, indem das Volumen der einzelnen Sequenzierungsreaktionen miniaturisiert wird, die die Größe der Instrumente einschränken und die Kosten von Reagenzien pro Reaktion minimieren. NGS wird in einer Vielzahl von Bereichen angewendet, darunter De -novo -Genomsequenzierung, Wiederausgleichung des gesamten Genoms, Transkriptomanalyse, gezielte Resequenzierung, kleine RNA- und miRNA -Sequenzierung, Ganzexomsequenzierung usw.

Unterschied zwischen der gesamten Genomsequenzierung und der Sequenzierung der nächsten Generation

Technologie

- Die gesamte Genomsequenzierung (WGS) ist eine umfassende Methode zur Analyse der gesamten genomischen DNA -Sequenz einer Zelle zu einem einzigen Zeitpunkt. Mit der Technologie können Wissenschaftler die genaue Abfolge aller Buchstaben lesen, aus denen Ihre vollständige DNA -Menge besteht. Die Sequenzierung der nächsten Generation, auch als massiv parallele Sequenzierung bekannt, ist eine relativ neue Technik, die die Sequenzierung eines DNA. Die Idee ist, große Mengen an DNA -Sequenzdaten durch massive Parallelisierung zu erzeugen.

Verfahren

- WGS ist ein Laborverfahren, das die Reihenfolge der Basen im Genom in einem einzigen Prozess identifiziert. Dazu wird eine Blut- oder Speichelprobe entnommen und an das Labor gesendet, in dem eine Maschine die DNA aufbricht und die Buchstaben wie ein Code liest. Forscher vergleichen dann Ihre DNA -Sequenz mit einer standardisierten Referenz und identifizieren die Variationen zwischen den beiden Buchstaben, die dazu führen, dass viele verschiedene Arten von persönlichen Informationen identifiziert werden. Das Prinzip von NGS ähnelt der traditionellen Kapillarelektrophorese -Methode, die drei grundlegende Schritte umfasst: DNA -Fragmentierung, Sequenzierung der Bibliotheken und Datenanalyse.

Anwendungen

- Die gesamte Genomsequenzierung beinhaltet die Sequenzierung des gesamten Genoms, um Mutationen und Umstände zu untersuchen. Mit der Sequenzierung des gesamten Genoms können Sie Genome de novo zusammenstellen, das Genom eines Organismus mit einem Referenzgenom vergleichen, neuartige Genomanordnung identifizieren, Pathogenausbrüche verfolgen, molekulare Evolution, Diagnose des vermuteten Mendelschen Syndroms und Krebs und vieles viel mehr. NGS-Technologien werden für die Sequenzierung des gesamten Genoms, Epigenetik, Transkriptomanalyse, De-novo-Genomsequenzierung, große Analyse der DNA.

Sequenzierung der nächsten Generation vs. Ganzes Genomsequenzierung: Vergleichstabelle

Zusammenfassung der Sequenzierung der nächsten Generation vs. Ganzes Genomsequenzierung

Es gibt keine klare Definition der Sequenzierung der nächsten Generation (NGS), aber es gibt mehrere Merkmale, die NGS-Plattformen von herkömmlichen DNA. NGS -Technologien werden routinemäßig in der zeitgenössischen molekularen Forschung angewendet und waren ein leistungsstarkes Instrument für viele klinische Anwendungen. Es ist eine großartige diagnostische Plattform, da sie das Potenzial für einen umfassenden Mutationsnachweis über mehrere genomische Ziele gleichzeitig, eine hohe Durchsatzanalyse von Patienten-Panels über Krankheitsloki sowie die Entdeckung von nicht-kodierenden RNAs und Proteinbindungsstellen bietet.